RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 RMDN1Q96DB5 314 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 FEZ1Q99689 392 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 NCK2O43639 380 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 B4GALT4O60513 344 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 GDF11O95390 407 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 SLC25A27O95847 323 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 TXLNAP40222 546 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 GNASQ5JWF2 1037 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF384Q8TF68 577 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 KCNB2Q92953 911 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 MKL1Q969V6 931 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 ASIC4Q96FT7 647 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 SCLYQ96I15 445 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 LCHNA4D1U4 455 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 CTAGE5O15320 804 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 MBTPS2O43462 519 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 MARCH6O60337 910 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 RAB11FIP3O75154 756 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 ALDH1L1O75891 902 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 GH2P01242 217 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 LDHCP07864 332 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 PTGIRP43119 386 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 GSTO1P78417 241 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 MECOMQ03112 1051 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 ITGA7Q13683 1181 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 SUCLG2Q96I99 432 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 MMP19Q99542 508 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 ABCF2Q9UG63 623 aa6.26□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 GRIN2DO15399 1336 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 CEP250Q9BV73 2442 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 LINC01553A4QN01 128 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 STXBP3O00186 592 aa6.25□□□□□ -1.41
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TRIM25-208ENST00000574234 GJB5O95377 273 aa6.25□□□□□ -1.41
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TRIM25-208ENST00000574234 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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TRIM25-208ENST00000574234 PHKA1P46020 1223 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 KCNJ6P48051 423 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 IGBP1P78318 339 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 TEX11Q8IYF3 940 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.25□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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TRIM25-208ENST00000574234 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.25□□□□□ -1.41
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TRIM25-208ENST00000574234 CLSTN1O94985 981 aa6.24□□□□□ -1.41
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TRIM25-208ENST00000574234 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 CBLBQ13191 982 aa6.24□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 ACVR2BQ13705 512 aa6.24□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 RASGRF1Q13972 1273 aa6.24□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 PLS1Q14651 629 aa6.24□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 HIF1AQ16665 826 aa6.24□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 ATP2B3Q16720 1220 aa6.24□□□□□ -1.41
TRIM25-208ENST00000574234 IER5Q5VY09 327 aa6.24□□□□□ -1.41
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