RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TADA3	O75528	432 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	KNG1	P01042	644 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	RAC3	P60763	192 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZPA2	131 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ADRA1B	P35368	520 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF2A2	P52657	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	SCRN1	Q12765	414 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP68	Q76N32	757 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXN1	O15353	648 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	CR2	P20023	1033 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	BMP5	P22003	454 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP8	Q13202	625 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	BVES	Q8NE79	360 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNH1	O95259	989 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP72	Q9P209	647 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957		H7BY64	318 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ARNTL	O00327	626 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TBX1	O43435	398 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX11B	O96011	259 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGB6	P18564	788 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	BCL6	P41182	706 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	NCAPH	Q15003	741 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	APBA2	Q99767	749 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO1B	O43795	1136 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO21	O94952	628 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPNS1	P04632	268 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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