RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549123.5

TCTN1-222, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2

Gene TCTN1, Length 458 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-222	ENST00000549123	DBH	P09172	617 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	PAM	P19021	973 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	TMC6	Q7Z403	805 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	KCTD3	Q9Y597	815 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	IRAK3	Q9Y616	596 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TCTN1-222	ENST00000549123	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	KIAA0232	Q92628	1395 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	AFF2	P51816	1311 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	CDR1	P51861	262 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	EPHB3	P54753	998 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	FXN	Q16595	210 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	LDHD	Q86WU2	507 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	MZB1	Q8WU39	189 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	COPS5	Q92905	334 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	GML	Q99445	158 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	SLIT3	O75094	1523 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	SLIT2	O94813	1529 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	NSD2	O96028	1365 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	ALS2	Q96Q42	1657 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123		E9PSI1	815 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	CHRNA2	Q15822	529 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	BTG4	Q9NY30	223 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	SUSD5	O60279	629 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	DDAH1	O94760	285 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	FBLN1	P23142	703 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	TACR1	P25103	407 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	SCRN1	Q12765	414 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	SSPN	Q14714	243 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	VPS72	Q15906	364 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	CABP7	Q86V35	215 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	MORC1	Q86VD1	984 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	LZTR1	Q8N653	840 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	MMP19	Q99542	508 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	PIK3C2A	O00443	1686 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	NFAT5	O94916	1531 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	MYOM1	P52179	1685 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	C7orf72	A4D263	438 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123		B2RBV5	119 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123		F8W031	263 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	NPHS1	O60500	1241 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	GLI4	P10075	376 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	PI3	P19957	117 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	EVA1C	P58658	441 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	SV2C	Q496J9	727 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	IP6K1	Q92551	441 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	MTA3	Q9BTC8	594 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	EPN3	Q9H201	632 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	CLEC1B	Q9P126	229 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TCTN1-222	ENST00000549123	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48

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