RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 SFR1Q86XK3 245 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 MTA3Q9BTC8 594 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 RGS12O14924 1447 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 MAPK4P31152 587 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ATP1A4Q13733 1029 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 AOX1Q06278 1338 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 PPP1R37O75864 691 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 CENPUQ71F23 418 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 RGL1Q9NZL6 768 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 TNNI1P19237 187 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 TAF12Q16514 161 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 RNF217Q8TC41 542 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 CUEDC2Q9H467 287 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.26□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC142Q17RM4 750 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 MTRQ99707 1265 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 AURKCQ9UQB9 309 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ZMYM3Q14202 1370 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ACADSP16219 412 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 DYNLT1P63172 113 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 MAP3K10Q02779 954 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 CATSPER2Q96P56 530 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 IL10P22301 178 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 NEK8Q86SG6 692 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 COG1Q8WTW3 980 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 BTBD6Q96KE9 485 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ASNA1O43681 348 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SASH1O94885 1247 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 LCA5LO95447 670 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 PDHBP11177 359 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 HSPA6P17066 643 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 USP14P54578 494 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 KDSRQ06136 332 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 GPBP1Q86WP2 473 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 NME9Q86XW9 330 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 PGBD1Q96JS3 809 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 GINS4Q9BRT9 223 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 BRAFP15056 766 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 COPB2P35606 906 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 WDR70Q9NW82 654 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 PFDN6O15212 129 aa9.25□□□□□ -0.93
ATXN3-216ENST00000545170 KRT1P04264 644 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms