RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.96□□□□□ -0.97
CLVS1-204ENST00000518858 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.96□□□□□ -0.97
CLVS1-204ENST00000518858 RRAGBQ5VZM2 374 aa8.96□□□□□ -0.97
CLVS1-204ENST00000518858 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.96□□□□□ -0.97
CLVS1-204ENST00000518858 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.96□□□□□ -0.97
CLVS1-204ENST00000518858 CD302Q8IX05 232 aa8.96□□□□□ -0.97
CLVS1-204ENST00000518858 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.96□□□□□ -0.97
CLVS1-204ENST00000518858 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.96□□□□□ -0.97
CLVS1-204ENST00000518858 SPATA20Q8TB22 786 aa8.96□□□□□ -0.97
CLVS1-204ENST00000518858 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.96□□□□□ -0.97
CLVS1-204ENST00000518858 BUB1O43683 1085 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 SHBGP04278 402 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 SERPINB2P05120 415 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 MYL1P05976 194 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 ABCD1P33897 745 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 PAFAH1B1P43034 410 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF844Q08AG5 666 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 LONP2Q86WA8 852 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 PHC3Q8NDX5 983 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 GDF3Q9NR23 364 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 RASSF10A6NK89 507 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 M0R2C6 588 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 UBOX5O94941 541 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 DPEP1P16444 411 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 PTPREP23469 700 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 KIF5BP33176 963 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 GUCA2AQ02747 115 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 NR5A1Q13285 461 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 CUL3Q13618 768 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 TNNI3KQ59H18 835 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 PAGE5Q96GU1 130 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 DNAJC7Q99615 494 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 MAST3O60307 1309 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 ORC4O43929 436 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 LILRB3O75022 631 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 FLT3P36888 993 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 KBTBD3Q8NAB2 608 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 SMAPO00193 183 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 GRM8O00222 908 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 SPTLC1O15269 473 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 ATP6V1G1O75348 118 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 IMPDH2P12268 514 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 PLCG2P16885 1265 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 KCNA3P22001 575 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 CCND1P24385 295 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 GUCY1A2P33402 732 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 PCK1P35558 622 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 ADAM22Q9P0K1 906 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 HYOU1Q9Y4L1 999 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 H0YGN5 161 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 TACC1O75410 805 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 ALADP13716 330 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 MYL6BP14649 208 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 NCALDP61601 193 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 TRIM29Q14134 588 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 TRIM14Q14142 442 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 SLMAPQ14BN4 828 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 TMC4Q7Z404 712 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-204ENST00000518858 MB21D1Q8N884 522 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms