RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 WDR59Q6PJI9 974 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 MUTP22033 750 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 LZTFL1Q9NQ48 299 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 TRAF5O00463 557 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 NFIBO00712 420 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 VCAM1P19320 739 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 COL20A1Q9P218 1284 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 A0A0U1RQJ8 604 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 SLITRK3O94933 977 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 GNA14O95837 355 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ARP10275 920 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 USP14P54578 494 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 DGKZQ13574 1117 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 MTMR2Q13614 643 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 SFR1Q86XK3 245 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 DYDC2Q96IM9 177 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 URI1O94763 535 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 NDUFA10O95299 355 aa25.3■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.3■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.3■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 CHMP2AO43633 222 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 BCRP11274 1271 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 KIF5CO60282 957 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 FLOT1O75955 427 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 RIT2Q99578 217 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 PNMA2Q9UL42 364 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ALAS1P13196 640 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 CASP5P51878 434 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 TPH2Q8IWU9 490 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 CPXCR1Q8N123 301 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ITGB5P18084 799 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGAP25P42331 645 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 CDK17Q00537 523 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 EPHA7Q15375 998 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 PARP14Q460N5 1801 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 RSPH10BP0C881 870 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 FDX1P10109 184 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 GAP43P17677 238 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 MAP3K9P80192 1104 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 SPP2Q13103 211 aa25.26■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.26■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 IL31RAQ8NI17 732 aa25.26■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 OLFML3Q9NRN5 406 aa25.26■■□□□ 1.63
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