RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 CTAGE15A4D2H0 777 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CTAGE8P0CG41 777 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 LRRC55Q6ZSA7 311 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 KRT26Q7Z3Y9 468 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CTAGE6Q86UF2 777 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CTAGE4Q8IX94 777 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 DYDC2Q96IM9 177 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 MYO1AQ9UBC5 1043 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 FEM1BQ9UK73 627 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 EML1O00423 815 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 OPLAHO14841 1288 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 GNA14O95837 355 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 FECHP22830 423 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 TNIP1Q15025 636 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC170Q8IYT3 715 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 EHBP1Q8NDI1 1231 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SCFD1Q8WVM8 642 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 AGBL1Q96MI9 1066 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 MBOAT7Q96N66 472 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 LRRC53A6NM62 1247 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RHOXF2BP0C7M4 288 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CIITAP33076 1130 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGAP25P42331 645 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC12A3P55017 1021 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 TNFAIP1Q13829 316 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 GIT2Q14161 759 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CEP55Q53EZ4 464 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 ARSHQ5FYA8 562 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM83AQ86UY5 434 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 LENG9Q96B70 501 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 HOOK2Q96ED9 719 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CAPZA3Q96KX2 299 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RHOXF2Q9BQY4 288 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 JADE2Q9NQC1 790 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 MYO6Q9UM54 1294 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RSPH10B2B2RC85 870 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RSPH10BP0C881 870 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RAPGEF1Q13905 1077 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 MAEAQ7L5Y9 396 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC16A10Q8TF71 515 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CEP63Q96MT8 703 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CNTNAP1P78357 1384 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 EPHB6O15197 1021 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CLIC2O15247 247 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 FLOT1O75955 427 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 HERVK_113P62684 666 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 PLS1Q14651 629 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCB11O95342 1321 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC26A4O43511 780 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 CALUO43852 315 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 TFRCP02786 760 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL13P26373 211 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 INPP5BP32019 993 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 MAGEA1P43355 309 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 MMP14P50281 582 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 EHHADHQ08426 723 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SPIRE1Q08AE8 756 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 TUBB2AQ13885 445 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 FKBP1CQ5VVH2 108 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 KRT222Q8N1A0 295 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 TUBB2BQ9BVA1 445 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RUSC1Q9BVN2 902 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1W2PQJ5 194 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RASSF10A6NK89 507 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 EYA4O95677 639 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 MYBP10242 640 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 KCNA3P22001 575 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 FIGNQ5HY92 759 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 RABGGTAQ92696 567 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SPAG5Q96R06 1193 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 TEKT3Q9BXF9 490 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 TTYH3Q9C0H2 523 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SIK3Q9Y2K2 1263 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-208ENST00000510829 PIK3CDO00329 1044 aa12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms