RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM13CQ8NE31 585 aa7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFT74Q96LB3 600 aa7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIF1BO60333 1816 aa7.51□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEMA3EO15041 775 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAD51CO43502 376 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDGFRBP09619 1106 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCNB1P14635 433 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAFAH1B1P43034 410 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRPC1P48995 793 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP11P51784 963 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDK17Q00537 523 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM14Q14142 442 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT71Q3SY84 523 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TLR10Q9BXR5 811 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDP2Q9P2J9 529 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF711Q9Y462 761 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 ENTPD5O75356 428 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 GALK1P51570 392 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMD7P51665 324 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 RHBDL3P58872 404 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIN52Q52LA3 116 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 STKLD1Q8NE28 680 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPATCH3Q96I76 525 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITM2BQ9Y287 266 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 MST1RQ04912 1400 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFNAR2P48551 515 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDE6CP51160 858 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTTPP55157 894 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBXN1Q04323 297 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 MEA1Q16626 185 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH2D4BQ5SQS7 431 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP49Q70CQ1 688 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 HESX1Q9UBX0 185 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPME1Q9Y570 386 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 STK24Q9Y6E0 443 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP7AQ04656 1500 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP5Q13017 1502 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 AFPP02771 609 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYBP10242 640 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNAT2P19087 354 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMARCA1P28370 1054 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 MGAT5Q09328 741 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 USH1GQ495M9 461 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 VPS37DQ86XT2 251 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAF4BQ92750 862 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 MPP4Q96JB8 637 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNX27Q96L92 541 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SETDB2Q96T68 719 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 DPH5Q9H2P9 285 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 THAP9Q9H5L6 903 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH2D4AQ9H788 454 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 NEO1Q92859 1461 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 LYNP07948 512 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms