RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487284.2

CUX1-209, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene CUX1, Length 1,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-209ENST00000487284 VAV3Q9UKW4 847 aa15.88■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ITGB5P18084 799 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 EDNRBP24530 442 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 PSMC4P43686 418 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 AMPD3Q01432 767 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 CAP1Q01518 475 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 RAD54LQ92698 747 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 SLC5A5Q92911 643 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 TRIM47Q96LD4 638 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 UIMC1Q96RL1 719 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 IWS1Q96ST2 819 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MXRA8Q9BRK3 442 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 STK24Q9Y6E0 443 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 GPR25O00155 361 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MEIS1O00470 390 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 FCGRTP55899 365 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MAP2K5Q13163 448 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 SV2BQ7L1I2 683 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 NIPA1Q7RTP0 329 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 USP6NLQ92738 828 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MED15Q96RN5 788 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 TSKSQ9UJT2 592 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 GJD2Q9UKL4 321 aa15.87■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 RHOBTB3O94955 611 aa15.86■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ARP10275 920 aa15.86■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 PDE4DQ08499 809 aa15.86■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 STXBP2Q15833 593 aa15.86■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ECM1Q16610 540 aa15.86■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.86■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 KCNK18Q7Z418 384 aa15.86■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ERMNQ8TAM6 284 aa15.86■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MAML3Q96JK9 1138 aa15.86■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 WDR11Q9BZH6 1224 aa15.86■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 PSMD10O75832 226 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 RGS20O76081 388 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 CYP2B6P20813 491 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MCM6Q14566 821 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 JADE2Q9NQC1 790 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MYH11P35749 1972 aa15.85■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 POTEB3A0JP26 581 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ASB14A6NK59 587 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 B4DLN1 442 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MED24O75448 989 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 HOXC6P09630 235 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ZNF18P17022 549 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 RPA1P27694 616 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 PPP2R5CQ13362 524 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MTMR1Q13613 665 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 KIF22Q14807 665 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 POTEBQ6S5H4 581 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ARMCX2Q7L311 632 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MORC4Q8TE76 937 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 FANCLQ9NW38 375 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.84■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MYMKA6NI61 221 aa15.83■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 STAM2O75886 525 aa15.83■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 RGS2P41220 211 aa15.83■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ASIC1P78348 528 aa15.83■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 LRCH2Q5VUJ6 765 aa15.83■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.83■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.83■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
CUX1-209ENST00000487284 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms