RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 ALG1L2C9J202 215 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 ITGB5P18084 799 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 GJA4P35212 333 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 ID4P47928 161 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 EPHA5P54756 1037 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 TMPRSS15P98073 1019 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 GRIN1Q05586 938 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF605Q86T29 641 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 ALG3Q92685 438 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 GPR39O43194 453 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 KIF11P52732 1056 aa6.68□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 EFHBQ8N7U6 833 aa6.68□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 HRKO00198 91 aa6.67□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 PMLP29590 882 aa6.67□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 DVL2O14641 736 aa6.66□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 XP32Q5T750 250 aa6.66□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.66□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 DTLQ9NZJ0 730 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 CYP17A1P05093 508 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 FAHP16930 419 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 MIB1Q86YT6 1006 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 CEP89Q96ST8 783 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 ACOT7O00154 380 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 FOXP2O15409 715 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 DDB1Q16531 1140 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 MLANAQ16655 118 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC5A5Q92911 643 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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