RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465931.1

PRRC2B-208, Transcript of proline rich coiled-coil 2B, human

TSL 2

Gene PRRC2B, Length 5,366 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRRC2B-208	ENST00000465931	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	VPS18	Q9P253	973 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	KCNK3	O14649	394 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	CAPN2	P17655	700 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	PLCG1	P19174	1290 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	NFKBIA	P25963	317 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	KRIT1	O00522	736 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	DTNB	O60941	627 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	CIITA	P33076	1130 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	MAPK6	Q16659	721 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	DENND2C	Q68D51	928 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	MARK3	P27448	753 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ADCY8	P40145	1251 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	MMP14	P50281	582 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	RNF139	Q8WU17	664 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	CIB2	O75838	187 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ARL4A	P40617	200 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	CARD6	Q9BX69	1037 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	TSC1	Q92574	1164 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931		F8W8V4	182 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ARPP19	P56211	112 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	SNAP25	P60880	206 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	KYAT1	Q16773	422 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	CDKL2	Q92772	493 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	NEDD4	P46934	1319 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931		H7C0C1	242 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ATP5O	P48047	213 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	TTC1	Q99614	292 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	COG2	Q14746	738 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	PSMB7	Q99436	277 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	CLIC2	O15247	247 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	LRRC41	Q15345	812 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PRRC2B-208	ENST00000465931	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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