RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444623.5

CSAD-208, Transcript of cysteine sulfinic acid decarboxylase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAD, Length 2,122 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSAD-208	ENST00000444623	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	POLR2M	P0CAP2	368 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	CXCL9	Q07325	125 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	SFR1	Q86XK3	245 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	CEP112	Q8N8E3	955 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	BAP1	Q92560	729 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	CEP63	Q96MT8	703 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CSAD-208	ENST00000444623	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	TBC1D12	O60347	775 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	RSPH10B	P0C881	870 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	WNT10B	O00744	389 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	CHMP2A	O43633	222 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	KRT86	O43790	486 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	HOXD13	P35453	343 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	TUBB2A	Q13885	445 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	FAM83A	Q86UY5	434 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	NEK11	Q8NG66	645 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	MYO6	Q9UM54	1294 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	APBA1	Q02410	837 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	ADAM9	Q13443	819 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	KIF20A	O95235	890 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	MYB	P10242	640 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	TRAF1	Q13077	416 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	KRT222	Q8N1A0	295 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	18.19	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	ZBTB39	O15060	712 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	PSMD10	O75832	226 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	NOL4	O94818	638 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	GNA14	O95837	355 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	NR2F2	P24468	414 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	KIF11	P52732	1056 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	VAV2	P52735	878 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	SPA17	Q15506	151 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	LDHD	Q86WU2	507 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	STK24	Q9Y6E0	443 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	SLITRK3	O94933	977 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	EYA4	O95677	639 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	POLD1	P28340	1107 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	PDXDC1	Q6P996	788 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	TPH2	Q8IWU9	490 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	SFI1	A8K8P3	1242 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	INPP5B	P32019	993 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	CEP55	Q53EZ4	464 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	FAM160B2	Q86V87	743 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	SLC5A5	Q92911	643 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	DYDC2	Q96IM9	177 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CSAD-208	ENST00000444623	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms