RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MUI8 341 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF263O14978 683 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIN3BO60391 1043 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 MXRA7P84157 204 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PAK1Q13153 545 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SPA17Q15506 151 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF11Q15544 211 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 STYK1Q6J9G0 422 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 TMC4Q7Z404 712 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA21Q7Z572 469 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 MDM1Q8TC05 714 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 GIPC2Q8TF65 315 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 NELFBQ8WX92 580 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT12Q99456 494 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SNED1Q8TER0 1413 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 COQ9O75208 318 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 RFC4P35249 363 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD17B3P37058 310 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK7P49862 253 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 NR5A1Q13285 461 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 TEKT4Q8WW24 435 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 OSBP2Q969R2 916 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 GSDMAQ96QA5 445 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PIF1Q9H611 641 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ORC4O43929 436 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF8O76064 485 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 FGAP02671 866 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF844Q08AG5 666 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 MEA1Q16626 185 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 WASHC4Q2M389 1173 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKS4BQ8N8V4 417 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 WHAMMQ8TF30 809 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 NLRP3Q96P20 1036 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 GGT7Q9UJ14 662 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 STXBP3O00186 592 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PRLRP16471 622 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CCND1P24385 295 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBP50607 506 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 HHATQ5VTY9 493 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC42Q96M95 316 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 MYD88Q99836 296 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SH2D4AQ9H788 454 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRD1A4D1F6 860 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP73A6NFT4 308 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS16A8MUM7 142 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 LGR5O75473 907 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 NQO1P15559 274 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF5BP33176 963 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 GUCY1A2P33402 732 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNT15Q8N3T1 639 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms