RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 RWDD2AQ9UIY3 292 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SOCS7O14512 581 aa17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SERPINC1P01008 464 aa17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 UBASH3AP57075 661 aa17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CNNM4Q6P4Q7 775 aa17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 MIER3Q7Z3K6 550 aa17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC27Q9C0I9 530 aa17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TUFT1Q9NNX1 390 aa17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D7Q9P0N9 293 aa17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TELO2Q9Y4R8 837 aa17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 STK24Q9Y6E0 443 aa17.13■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC41Q15345 812 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC186Q7Z3E2 898 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PANK4Q9NVE7 773 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SOWAHBA6NEL2 793 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 UNCXA6NJT0 531 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 BTBD19C9JJ37 291 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SORBS3O60504 671 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CDC25BP30305 580 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 EHHADHQ08426 723 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CCL15Q16663 113 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 HS1BP3Q53T59 392 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 BRI3BPQ8WY22 251 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 WDR81Q562E7 1941 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PDHXO00330 501 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 EYA4O95677 639 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CCNE2O96020 404 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PGK2P07205 417 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PTGS1P23219 599 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 COASYQ13057 564 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 GIT2Q14161 759 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 XRRA1Q6P2D8 792 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RUSC1Q9BVN2 902 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D22BQ9NU19 505 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO40Q9UH90 709 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SAMM50Q9Y512 469 aa17.11■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 KRT18P05783 430 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CETPP11597 493 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 GTF2A2P52657 109 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FKBP1BP68106 108 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ARID5BQ14865 1188 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CDKAL1Q5VV42 579 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD40Q6AI12 368 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 NLRX1Q86UT6 975 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 EEF2KMTQ96G04 330 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 LXNQ9BS40 222 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ZHX3Q9H4I2 956 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 INTS13Q9NVM9 706 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 POTEB2H3BUK9 544 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RSPH10BP0C881 870 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SP2Q02086 613 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SPRYD7Q5W111 196 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RINT1Q6NUQ1 792 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CREBRFQ8IUR6 639 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 GPRASP2Q96D09 838 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PTPN18Q99952 460 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PORCNQ9H237 461 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 KCNF1Q9H3M0 494 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SEMA6BQ9H3T3 888 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa17.1■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PFASO15067 1338 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SFI1A8K8P3 1242 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ESPNB1AK53 854 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A27O95847 323 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 KCNA2P16389 499 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ERVK-9P63128 1117 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ERVK-24P63145 666 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 STIM1Q13586 685 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 STXBP2Q15833 593 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 WDR78Q5VTH9 848 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 IRF2BP1Q8IU81 584 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 FAM43AQ8N2R8 423 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 DNERQ8NFT8 737 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 IWS1Q96ST2 819 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 REEP2Q9BRK0 252 aa17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PSMA7O14818 248 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 P4HBP07237 508 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CCNE1P24864 410 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PSMD2Q13200 908 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 UGCGQ16739 394 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TTI2Q6NXR4 508 aa17.08■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SEPT14Q6ZU15 432 aa17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms