RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 STAT3P40763 770 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC102AQ96A19 550 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 SBF1O95248 1867 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 DGKZQ13574 1117 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 UNC13DQ70J99 1090 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 PSMA7O14818 248 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 FCER1AP12319 257 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF76P36508 570 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 STK4Q13043 487 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 CNGA4Q8IV77 575 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 FAM20AQ96MK3 541 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 DOCK1Q14185 1865 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF536O15090 1300 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 MSH4O15457 936 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 TEX33O43247 280 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 ICAM1P05362 532 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 VSNL1P62760 191 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 RPAINQ86UA6 219 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 DESI2Q9BSY9 194 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS1-204ENST00000352260 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 POTEB3A0JP26 581 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 POTECB2RU33 542 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 USP8P40818 1118 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SPAG1Q07617 926 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 KRT31Q15323 416 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 POTEBQ6S5H4 581 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 DYMQ7RTS9 669 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 GPC2Q8N158 579 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 KCNJ18B7U540 433 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 MED24O75448 989 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PBX1P40424 430 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 MTMR2Q13614 643 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 KCNJ12Q14500 433 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 TTI2Q6NXR4 508 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 DDX12PQ92771 950 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 HPS3Q969F9 1004 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 HOOK2Q96ED9 719 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R2P41236 205 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 P2RX5Q93086 422 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 WDR18Q9BV38 432 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 GGA3Q9NZ52 723 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 VAV3Q9UKW4 847 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 E9PMD0 336 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 MFAP3LO75121 409 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 RNF40O75150 1001 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 VCAM1P19320 739 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 CCNE1P24864 410 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 EPS15P42566 896 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-204ENST00000352260 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms