RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 KCNA3P22001 575 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 PRUNE1Q86TP1 453 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 OLFM1Q99784 485 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 ADCK1Q86TW2 530 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 GINS4Q9BRT9 223 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 NLRX1Q86UT6 975 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 P2RX5Q93086 422 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 ANGPT1Q15389 498 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 ME3Q16798 604 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 THAP11Q96EK4 314 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 CASP2P42575 452 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 PYCARDQ9ULZ3 195 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.92□□□□□ -1.46
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