RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CHTF18-202ENST00000317063 STX17P56962 302 aa18.16■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 KMT5BQ4FZB7 885 aa18.16■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 ZIC5Q96T25 663 aa18.16■□□□□ 0.5
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CHTF18-202ENST00000317063 PNMA3Q9UL41 463 aa18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 TEKT3Q9BXF9 490 aa18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 RPA1P27694 616 aa18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 FBXO40Q9UH90 709 aa18.15■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 DOCK3Q8IZD9 2030 aa18.14■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa18.14■□□□□ 0.49
CHTF18-202ENST00000317063 IDEP14735 1019 aa18.14■□□□□ 0.49
CHTF18-202ENST00000317063 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CHTF18-202ENST00000317063 PPP2R5CQ13362 524 aa18.14■□□□□ 0.49
CHTF18-202ENST00000317063 KRT222Q8N1A0 295 aa18.14■□□□□ 0.49
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