RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MB21D1Q8N884 522 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGL1Q9NZL6 768 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LCTP09848 1927 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX15O43143 795 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PBX1P40424 430 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.496e-7■■■■□ 20.7
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LBX2Q6XYB7 198 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHMP2AO43633 222 aa24.33■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPIL2Q13356 520 aa24.33■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.493e-6■■■■□ 22.7
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.33■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.33■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.33■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OTUD5Q96G74 571 aa24.33■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DYDC2Q96IM9 177 aa24.33■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.33■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.33■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.33■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHST13Q8NET6 341 aa24.32■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.32■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D22BQ9NU19 505 aa24.32■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SKILP12757 684 aa24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCND2P30279 289 aa24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC63Q05C16 580 aa24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GIT2Q14161 759 aa24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MOB2Q70IA6 237 aa24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.31■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITIH6Q6UXX5 1313 aa24.3■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.3■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEX33O43247 280 aa24.3■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.3■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPH2Q8IWU9 490 aa24.3■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.3■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NACC1Q96RE7 527 aa24.3■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR3C2P08235 984 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLS1Q14651 629 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPRASP2Q96D09 838 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 REEP2Q9BRK0 252 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNCXA6NJT0 531 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 N4BP3O15049 544 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAFGO15525 162 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRDCO43847 1150 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC112Q8NEF3 446 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCND2Q9NZV8 630 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO40Q9UH90 709 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.29■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAM2O75886 525 aa24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF20AO95235 890 aa24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNJ6P48051 423 aa24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LXNQ9BS40 222 aa24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAB2Q9NYJ8 693 aa24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN21Q16825 1174 aa24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OPTNQ96CV9 577 aa24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMX1Q9H3N1 280 aa24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BTBD7Q9P203 1132 aa24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 P4HBP07237 508 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MOGSQ13724 837 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRX1Q86UT6 975 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS16Q9H269 839 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCND1Q9NSA2 647 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PFASO15067 1338 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LGALS16A8MUM7 142 aa24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.9 ms