RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 DYDC2Q96IM9 177 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 MYPNQ86TC9 1320 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 SLITRK3O94933 977 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 UBXN1Q04323 297 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 GIT2Q14161 759 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 EPHA7Q15375 998 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 PANX2Q96RD6 677 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TSG101Q99816 390 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 KCNH7Q9NS40 1196 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 RIPK3Q9Y572 518 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 ATP2A1O14983 1001 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP6O43182 974 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM14Q14142 442 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TKFCQ3LXA3 575 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 BHMT2Q9H2M3 363 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 JADE2Q9NQC1 790 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 STX10O60499 249 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TPM2P07951 284 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 PGM5Q15124 567 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 NSMFQ6X4W1 530 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 MB21D1Q8N884 522 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF507Q8TCN5 953 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PQC6 194 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 MFAP3LO75121 409 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 GYPCP04921 128 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 CEP135Q66GS9 1140 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TPH2Q8IWU9 490 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 REEP2Q9BRK0 252 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 PXMP2Q9NR77 195 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 PTPRFP10586 1907 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 KIF20AO95235 890 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TPM1P09493 284 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 ZCWPW2Q504Y3 356 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 NEK9Q8TD19 979 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 RMDN3Q96TC7 470 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D7Q9P0N9 293 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 IQCA1LA6NCM1 817 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 DNM2P50570 870 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM132BQ14DG7 1078 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 NYAP1Q6ZVC0 841 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 CNGA4Q8IV77 575 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC51Q96ER9 411 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 PDCD2LQ9BRP1 358 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 CSADQ9Y600 493 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 CCP110O43303 1012 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 TNNT1P13805 278 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 EEF2KMTQ96G04 330 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 PRIMPOLQ96LW4 560 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 RUSC1Q9BVN2 902 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 CASP14P31944 242 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 MTMR1Q13613 665 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC55Q6ZSA7 311 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 ZHX3Q9H4I2 956 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 SCN4AP35499 1836 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 DHX15O43143 795 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF16Q5VV41 709 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 XRRA1Q6P2D8 792 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 PIGOQ8TEQ8 1089 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 CPLX3Q8WVH0 158 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 NACC1Q96RE7 527 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 B4DLN1 442 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 RINT1Q6NUQ1 792 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 SCFD1Q8WVM8 642 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 PES1O00541 588 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 PTPN14Q15678 1187 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 MIER3Q7Z3K6 550 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 SFR1Q86XK3 245 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD8-201ENST00000313173 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms