RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF449Q6P9G9 518 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF662Q6ZS27 426 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SYNE4Q8N205 404 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 UIMC1Q96RL1 719 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TTYH3Q9C0H2 523 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PLCG1P19174 1290 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 NCALDP61601 193 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ERMARDQ5T6L9 678 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LCORLQ8N3X6 602 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PHF20Q9BVI0 1012 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PIK3C2AO00443 1686 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GVG6 124 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CABP7Q86V35 215 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ZMYND12Q9H0C1 365 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 F8VZ95 297 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 MARCH6O60337 910 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RFC5P40937 340 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ABL2P42684 1182 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 UBE4AQ14139 1066 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ASIC2Q16515 512 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 NELFCDQ8IXH7 590 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RPS6KC1Q96S38 1066 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 A0A087X0T9 212 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC169A6NNP5 214 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 AHCYL1O43865 530 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 FAM228BP0C875 321 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ERFP50548 548 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 COPS2P61201 443 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LETM2Q2VYF4 491 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 MIIPQ5JXC2 388 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PDXDC1Q6P996 788 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 NEK9Q8TD19 979 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TSG101Q99816 390 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 GRID2IPA4D2P6 1211 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 C5orf60A6NFR6 353 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 GSTA1P08263 222 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LONP1P36776 959 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PDE6CP51160 858 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 MAN2A1Q16706 1144 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SHISA4Q96DD7 197 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ERGIC2Q96RQ1 377 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 VCXQ9H320 206 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 FGGP02679 453 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 FGFR4P22455 802 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 HSPA2P54652 639 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CUL3Q13618 768 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 UBE3CQ15386 1083 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RNF220Q5VTB9 566 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TMC3Q7Z5M5 1100 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CNBD1Q8NA66 436 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ITFG2Q969R8 447 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 NUDCD1Q96RS6 583 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TACC3Q9Y6A5 838 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RTL9Q8NET4 1388 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PKN1Q16512 942 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RASIP1Q5U651 963 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TCERG1LQ5VWI1 586 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RAB17Q9H0T7 212 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL14Q9P2G3 628 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 CYP7A1P22680 504 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 CASP7P55210 303 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 FAM47AQ5JRC9 791 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 FAM83BQ5T0W9 1011 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 CNNM4Q6P4Q7 775 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 GLG1Q92896 1179 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 ADAM22Q9P0K1 906 aa12.4□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 H0YGN5 161 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 CETN3O15182 167 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRR-201ENST00000283228 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms