RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 NR2F2P24468 414 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 EPS15P42566 896 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ANO3Q9BYT9 981 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 NFU1Q9UMS0 254 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
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GINS1-201ENST00000262460 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 HOXD13P35453 343 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 AOC3Q16853 763 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CHADLQ6NUI6 762 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ACER1Q8TDN7 264 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 KRT12Q99456 494 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 REEP2Q9BRK0 252 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 GAKO14976 1311 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CCDC66A2RUB6 948 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 LAD1O00515 517 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 MEIS2O14770 477 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 GUCY2DQ02846 1103 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 KCNH2Q12809 1159 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 GALNT17Q6IS24 598 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 PDXDC1Q6P996 788 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 TPH2Q8IWU9 490 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 SAMM50Q9Y512 469 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 F5H6K3 240 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 TACC1O75410 805 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 KLRC3Q07444 240 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 BANK1Q8NDB2 785 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 FAM107BQ9H098 131 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ACP6Q9NPH0 428 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 GCNT3O95395 438 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CALCAP01258 141 aa9.56□□□□□ -0.88
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GINS1-201ENST00000262460 TRIM49CP0CI26 452 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 PLCG2P16885 1265 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ABCB4P21439 1286 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ZNF76P36508 570 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ARHGAP4P98171 946 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ICA1Q05084 483 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 PTK2Q05397 1052 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 LRRC31Q6UY01 552 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 TEKT1Q969V4 418 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 BRCA2P51587 3418 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 BBOX1O75936 387 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 AKAP3O75969 853 aa9.55□□□□□ -0.88
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GINS1-201ENST00000262460 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.55□□□□□ -0.88
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GINS1-201ENST00000262460 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 TSG101Q99816 390 aa9.55□□□□□ -0.88
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GINS1-201ENST00000262460 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 NDUFB10O96000 172 aa9.55□□□□□ -0.88
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GINS1-201ENST00000262460 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.54□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.54□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 AADACL2Q6P093 401 aa9.54□□□□□ -0.88
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