RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 BARHL2Q9NY43 387 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 SCN9AQ15858 1988 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 A0A1B0GVL5 298 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 CBFA2T2O43439 604 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 TTLL1O95922 423 aa9.28□□□□□ -0.92
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CTXN3-204ENST00000620385 CYP2D6P10635 497 aa9.28□□□□□ -0.92
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CTXN3-204ENST00000620385 NOS2P35228 1153 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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CTXN3-204ENST00000620385 IQCB1Q15051 598 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 TTC38Q5R3I4 469 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.28□□□□□ -0.92
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CTXN3-204ENST00000620385 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 BLIDQ8IZY5 108 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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CTXN3-204ENST00000620385 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-204ENST00000620385 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.28□□□□□ -0.92
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CTXN3-204ENST00000620385 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 USP17L3A6NCW0 530 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 USP17L4A6NCW7 530 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SLC26A4O43511 780 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF75DP51815 510 aa9.27□□□□□ -0.93
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CTXN3-204ENST00000620385 CCDC93Q567U6 631 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.27□□□□□ -0.93
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CTXN3-204ENST00000620385 TBCELQ5QJ74 424 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 DACT2Q5SW24 774 aa9.26□□□□□ -0.93
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CTXN3-204ENST00000620385 TRIM5Q9C035 493 aa9.26□□□□□ -0.93
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CTXN3-204ENST00000620385 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 RNF112Q9ULX5 631 aa9.26□□□□□ -0.93
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CTXN3-204ENST00000620385 STXBP3O00186 592 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 NMT2O60551 498 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 KCNJ6P48051 423 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 EPHA4P54764 986 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 GRIK5Q16478 980 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-204ENST00000620385 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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