RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 DCAF5Q96JK2 942 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 LRRC53A6NM62 1247 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ARHGAP4P98171 946 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 SELENONQ9NZV5 590 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 PLCD1P51178 756 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 DRP2Q13474 957 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 KBTBD13C9JR72 458 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 INPP5BP32019 993 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 C2orf54Q08AI8 447 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 C16orf72Q14CZ0 275 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 STXBP2Q15833 593 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 RBBP7Q16576 425 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ABCB5Q2M3G0 1257 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 BBOF1Q8ND07 529 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 GSDMAQ96QA5 445 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 SMCO2A6NFE2 343 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 EHHADHQ08426 723 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 SPOPLQ6IQ16 392 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 CCDC138Q96M89 665 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 EXO5Q9H790 373 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 PANK4Q9NVE7 773 aa9.13□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 PLXNC1O60486 1568 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 CCND2P30279 289 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 SKOR1P84550 965 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 PPARAQ07869 468 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ASPHQ12797 758 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 PEX26Q7Z412 305 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 C21orf2O43822 256 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 HMBSP08397 361 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 KDM5CP41229 1560 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 CTSWP56202 376 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ICA1Q05084 483 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 KCTD16Q68DU8 428 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 TRPA1O75762 1119 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 PPP3CCP48454 512 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 STX1BP61266 288 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 CERS3Q8IU89 383 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 TMEM87BQ96K49 555 aa9.12□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 PAMP19021 973 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 TAF11Q15544 211 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 CIITAP33076 1130 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ZNF445P59923 1031 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 TCEA2Q15560 299 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 ALFQ53S48 1182 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 OR6B2Q6IFH4 312 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 KCTD6Q8NC69 237 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 FANCLQ9NW38 375 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 KRT87PA6NCN2 255 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 GCKRQ14397 625 aa9.11□□□□□ -0.95
PDPR-210ENST00000568530 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms