RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542167.2

PUS1-208, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUS1, Length 2,151 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-208ENST00000542167 NEK8Q86SG6 692 aa18.27■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 CABS1Q96KC9 395 aa18.27■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 STK17AQ9UEE5 414 aa18.27■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa18.27■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 USP17L3A6NCW0 530 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 USP17L4A6NCW7 530 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 TM4SF1P30408 202 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 NAB2Q15742 525 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 MEI1Q5TIA1 1274 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 PNMA5Q96PV4 448 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 KRT12Q99456 494 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 CEP72Q9P209 647 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 MYH4Q9Y623 1939 aa18.26■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 FTCDO95954 541 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 SERPINB2P05120 415 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 MDH1P40925 334 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 NAPAP54920 295 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 C12orf60Q5U649 245 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 FOXR2Q6PJQ5 311 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 NLRP14Q86W24 1093 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 NOL4O94818 638 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 SERPING1P05155 500 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 EHHADHQ08426 723 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 CCT8L2Q96SF2 557 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 GGA2Q9UJY4 613 aa18.25■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 RAD51CO43502 376 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 KLRC1P26715 233 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 DDR1Q08345 913 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 TRADDQ15628 312 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 SPZ1Q9BXG8 430 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 NLRC4Q9NPP4 1024 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 FAM107AO95990 144 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 ERCC3P19447 782 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 DNA2P51530 1060 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 SEC24CP53992 1094 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 ZCWPW2Q504Y3 356 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 SFMBT2Q5VUG0 894 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 DYMQ7RTS9 669 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 LZTS2Q9BRK4 669 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 VCPKMTQ9H867 229 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 TMEM59LQ9UK28 342 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 PLAAQ9Y263 795 aa18.24■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 H0YHG0 523 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 ECHS1P30084 290 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 USP38Q8NB14 1042 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 MTMR9Q96QG7 549 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 TMEM47Q9BQJ4 181 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 CPVLQ9H3G5 476 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 TMBIM4Q9HC24 238 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 PLCB1Q9NQ66 1216 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 MTMR7Q9Y216 660 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 SMCO2A6NFE2 343 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 RPS8P62241 208 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 PLCB4Q15147 1175 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 SLC18A3Q16572 532 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 LRIG3Q6UXM1 1119 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 TBCKQ8TEA7 893 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 CAMKK2Q96RR4 588 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 C6orf50Q9HD87 102 aa18.23■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 KLRF2D3W0D1 207 aa18.22■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.511e-6■□□□□ 8.7
PUS1-208ENST00000542167 TNNC1P63316 161 aa18.22■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 CEP85LQ5SZL2 805 aa18.22■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.22■□□□□ 0.51
PUS1-208ENST00000542167 C6orf89Q6UWU4 347 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms