RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542011.1

VSIG10-208, Transcript of V-set and immunoglobulin domain containing 10, human

TSL 3

Gene VSIG10, Length 572 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VSIG10-208	ENST00000542011	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	HSPA4	P34932	840 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	KCNJ6	P48051	423 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	FGD1	P98174	961 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	FUT2	Q10981	343 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	SEMA3F	Q13275	785 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	MYLIP	Q8WY64	445 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	JADE2	Q9NQC1	790 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	BARHL2	Q9NY43	387 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	NRCAM	Q92823	1304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ESYT2	A0FGR8	921 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	NEFL	P07196	543 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ZNF286B	P0CG31	522 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	MTMR1	Q13613	665 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	IKBKE	Q14164	716 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	APBB2	Q92870	758 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	NID2	Q14112	1375 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	NFASC	O94856	1347 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	DLL1	O00548	723 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	LGR5	O75473	907 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	RSPH10B	P0C881	870 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	KCNA2	P16389	499 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ITGB5	P18084	799 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	RXRA	P19793	462 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	PBX2	P40425	430 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC26A2	P50443	739 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ADCY7	P51828	1080 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	NAPA	P54920	295 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	EVC	P57679	992 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	CHMP4BP1	P59074	171 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	FAM26D	Q5JW98	314 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	RSPH3	Q86UC2	560 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	GNA11	P29992	359 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	SREBF1	P36956	1147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ADAM17	P78536	824 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	GPNMB	Q14956	572 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	CEP55	Q53EZ4	464 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	SEPT8	Q92599	483 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	RAD9A	Q99638	391 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	SDF4	Q9BRK5	362 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
VSIG10-208	ENST00000542011	SMCO2	A6NFE2	343 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VSIG10-208	ENST00000542011	STXBP3	O00186	592 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VSIG10-208	ENST00000542011	MEIS1	O00470	390 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VSIG10-208	ENST00000542011	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
VSIG10-208	ENST00000542011	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
VSIG10-208	ENST00000542011	TLL1	O43897	1013 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VSIG10-208	ENST00000542011	NBN	O60934	754 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VSIG10-208	ENST00000542011	GJB5	O95377	273 aa		11.08	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms