RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 MCM6Q14566 821 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 COG2Q14746 738 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 RIPK3Q9Y572 518 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP3A4P08684 503 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNE1P24864 410 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CIITAP33076 1130 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 STK4Q13043 487 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TTI2Q6NXR4 508 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 P2RX5Q93086 422 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 OTUD5Q96G74 571 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 MYMKA6NI61 221 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 FDX1P10109 184 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 GHRHRQ02643 423 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 PPATQ06203 517 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC13DQ70J99 1090 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 ERO1BQ86YB8 467 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 CNGA4Q8IV77 575 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 RRAGCQ9HB90 399 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-211ENST00000539589 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 UBXN2AP68543 259 aa22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 Q4G0T1 1027 aa22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC51Q96ER9 411 aa22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC26A4O43511 780 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM14Q14142 442 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PRR16Q569H4 304 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 MFAP3LO75121 409 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 FCER1AP12319 257 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 HYIQ5T013 277 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 CASP14P31944 242 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 UBXN1Q04323 297 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 TSC1Q92574 1164 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 GYPCP04921 128 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 DYMQ7RTS9 669 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 LGALS16A8MUM7 142 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 TBX3O15119 743 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 GJA5P36382 358 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 MOGSQ13724 837 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ECM1Q16610 540 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNK18Q7Z418 384 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX12PQ92771 950 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 OPTNQ96CV9 577 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 RPTORQ8N122 1335 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 CXCL11O14625 94 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 MSH4O15457 936 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PEX10O60683 326 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 OAZ1P54368 228 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMD2Q13200 908 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PPIL2Q13356 520 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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