RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 FOXO4P98177 505 aa5.72□□□□□ -1.49
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CLVS1-209ENST00000522928 JAM2P57087 298 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 RBM10P98175 930 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 CAP1Q01518 475 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 TUSC3Q13454 348 aa5.67□□□□□ -1.5
CLVS1-209ENST00000522928 TEPPQ6URK8 271 aa5.67□□□□□ -1.5
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