RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 SMARCA1P28370 1054 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP4P98171 946 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SP4Q02446 784 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 IL17AQ16552 155 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 EHD4Q9H223 541 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC181Q5TID7 509 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 GPBP1Q86WP2 473 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TPH2Q8IWU9 490 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC65Q8IXS2 484 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FAM151AQ8WW52 585 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PICK1Q9NRD5 415 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 BCORQ6W2J9 1755 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP6O43182 974 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 POLR2MP0CAP2 368 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FCER1AP12319 257 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 STAT3P40763 770 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 HHATQ5VTY9 493 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1328Q86T90 577 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 EXOC4Q96A65 974 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC18Q9H819 358 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 DNM3Q9UQ16 869 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ESYT2A0FGR8 921 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC175P0C221 793 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CASP14P31944 242 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 KRT31Q15323 416 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 WDR78Q5VTH9 848 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CNGA4Q8IV77 575 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM9Q9C026 710 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CUEDC2Q9H467 287 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SNED1Q8TER0 1413 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 POTEB3A0JP26 581 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 POTECB2RU33 542 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 E9PMD0 336 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 POTEBQ6S5H4 581 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 DDX12PQ92771 950 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FAM107BQ9H098 131 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SMAPO00193 183 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 KIF5CO60282 957 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 GAS7O60861 476 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 AP1G2O75843 785 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 RBL2Q08999 1139 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PDIA5Q14554 519 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MICALL2Q8IY33 904 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ERO1AQ96HE7 468 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PANK4Q9NVE7 773 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 POTEFA5A3E0 1075 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 B4DLN1 442 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 WNT10BO00744 389 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 POTEIP0CG38 1075 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 NF2P35240 595 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PLA2G4AP47712 749 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 STK4Q13043 487 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.64□□□□□ -1.03
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