RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511338.1

SEC31A-232, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SEC31A, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-232ENST00000511338 PMM2O15305 246 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 AP1G1O43747 822 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 MYO1BO43795 1136 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TCEA3O75764 348 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 VAV1P15498 845 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ELNP15502 786 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 PAMP19021 973 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SERPINB3P29508 390 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 LSP1P33241 339 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 GPR3P46089 330 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 PHC1P78364 1004 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ADCY1Q08828 1119 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ZNF174Q15697 407 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ERAP2Q6P179 960 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 LMBR1Q8WVP7 490 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 GJA10Q969M2 543 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TEKT5Q96M29 485 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 MMP19Q99542 508 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TERF2IPQ9NYB0 399 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SLC12A8A0AV02 714 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 OFD1O75665 1012 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 GSTM1P09488 218 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 PDE6AP16499 860 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SLC9A1P19634 815 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TRAPPC10P48553 1259 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 POU5F1BQ06416 359 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 INF2Q27J81 1249 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SGO2Q562F6 1265 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 MBLAC2Q68D91 279 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 MYRIPQ8NFW9 859 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TCTN2Q96GX1 697 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TNIP3Q96KP6 325 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TAAR9Q96RI9 348 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 KCNJ15Q99712 375 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 CEP41Q9BYV8 373 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TOMM22Q9NS69 142 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 FAM229AH3BQW9 127 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TBX3O15119 743 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 LEFTY1O75610 366 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ALX3O95076 343 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ZNF205O95201 554 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 GLB1P16278 677 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 KRT15P19012 456 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 AKAP5P24588 427 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 USP14P54578 494 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 GJA9P57773 515 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 IRF9Q00978 393 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 LSAMPQ13449 338 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ANO1Q5XXA6 986 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 OSTM1Q86WC4 334 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 PARD3BQ8TEW8 1205 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 RNF38Q9H0F5 515 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 CSRNP2Q9H175 543 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 PCIF1Q9H4Z3 704 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 KLHL11Q9NVR0 708 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 DNM3Q9UQ16 869 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-232ENST00000511338 KDM1AO60341 852 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms