RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 A0A1B0GUL6 1792 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 GNA11P29992 359 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 COASYQ13057 564 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 NAB2Q15742 525 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 CEP95Q96GE4 821 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 FNTAP49354 379 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 SERPING1P05155 500 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 GALNT17Q6IS24 598 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ODF2Q5BJF6 829 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 KRT79Q5XKE5 535 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 MTMR9Q96QG7 549 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ITGA4P13612 1032 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 HSD17B3P37058 310 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 PANK4Q9NVE7 773 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 CDK8P49336 464 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 QPCTQ16769 361 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 USP38Q8NB14 1042 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 TAF4BQ92750 862 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 CEP72Q9P209 647 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRG-207ENST00000495879 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 SLC9A1P19634 815 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 EPS15P42566 896 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 LRRC63Q05C16 580 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 CNPY4Q8N129 248 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 RAD21O60216 631 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 PTK2Q05397 1052 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 SLC18A3Q16572 532 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 DPH5Q9H2P9 285 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 SLURP2P0DP57 97 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 RPS6KA1Q15418 735 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 TNFRSF8P28908 595 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 COPB2P35606 906 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 AMACRQ9UHK6 382 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 PPP1R2P41236 205 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 ASIC2Q16515 512 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 ANKS1AQ92625 1134 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 CABS1Q96KC9 395 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 CASZ1Q86V15 1759 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 SLC16A2P36021 539 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 DDB1Q16531 1140 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 GJB7Q6PEY0 223 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 NLRP3Q96P20 1036 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 DAPK3O43293 454 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 ECHS1P30084 290 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 STAT3P40763 770 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 STK17AQ9UEE5 414 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 TNNC1P63316 161 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 POTEB3A0JP26 581 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRG-207ENST00000495879 POTECB2RU33 542 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms