RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM228B	P0C875	321 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	NR1D1	P20393	614 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	LSP1	P33241	339 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	NT5C2	P49902	561 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	ADCY7	P51828	1080 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	GSTO1	P78417	241 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PSMD2	Q13200	908 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69	3e-9	■□□□□ 10.9
ZNF3-215	ENST00000487620	ECM1	Q16610	540 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PANK4	Q9NVE7	773 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	SNED1	Q8TER0	1413 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620		H0YHG0	523 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	RAD51C	O43502	376 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	BTD	P43251	543 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PROM2	Q8N271	834 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNK3	O14649	394 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	GUCY2C	P25092	1073 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PDIA5	Q14554	519 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	UBE2S	Q16763	222 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	TAF4B	Q92750	862 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PLAA	Q9Y263	795 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	MNAT1	P51948	309 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	SEC24C	P53992	1094 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	TEX11	Q8IYF3	940 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	WHAMM	Q8TF30	809 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	EPN3	Q9H201	632 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	EDIL3	O43854	480 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	LDHC	P07864	332 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	TNNC1	P63316	161 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	ASIC2	Q16515	512 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	NAA35	Q5VZE5	725 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	USP38	Q8NB14	1042 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	SBF2	Q86WG5	1849 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	ESYT2	A0FGR8	921 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620		E9PMD0	336 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	MYO1F	O00160	1098 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PPP1R37	O75864	691 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PPP4C	P60510	307 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	MREG	Q8N565	214 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	STRC	Q7RTU9	1775 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620		E7EVH7	732 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	PDHB	P11177	359 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ZNF3-215	ENST00000487620	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69

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