RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 C5orf60A6NFR6 353 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ZPR1O75312 459 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TACC1O75410 805 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 FERP16591 822 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RFX1P22670 979 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 COPB2P35606 906 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP3K12Q12852 859 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PAGE5Q96GU1 130 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 EPSTI1Q96J88 318 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS33BQ9H267 617 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NID2Q14112 1375 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR90Q96KV7 1748 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GVG6 124 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 A6NHS1 94 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RRM1P23921 792 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TBX4P57082 545 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PARP10Q53GL7 1025 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 COPS6Q7L5N1 327 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 P3H4Q92791 437 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PIDD1Q9HB75 910 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 DPPA5A6NC42 116 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 EVI5O60447 810 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 TGFB3P10600 412 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PYGBP11216 843 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 RIPK1Q13546 671 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ERICH1Q86X53 443 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 GDF3Q9NR23 364 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 B4DLN1 442 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 F8W031 263 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 GNPATO15228 680 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP3K13O43283 966 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMTA2O94983 1202 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM200BP0CF97 657 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 DRD4P21917 467 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP2R2AP63151 447 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ2P63252 427 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 IGBP1P78318 339 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SPAG1Q07617 926 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 LONRF1Q17RB8 773 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CHADLQ6NUI6 762 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 MREGQ8N565 214 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 MB21D1Q8N884 522 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC197Q8NCU1 140 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 MYL10Q9BUA6 226 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 NYXQ9GZU5 481 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 RGL1Q9NZL6 768 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 LAMB1P07942 1786 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKL5O76039 1030 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SOGA3Q5TF21 947 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 NCOA7Q8NI08 942 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CNKSR1Q969H4 720 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 SENP2Q9HC62 589 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-203ENST00000439720 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms