RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438356.1

RBM33-208, Transcript of RNA binding motif protein 33, human

TSL 4

Gene RBM33, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM33-208	ENST00000438356	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	WASF1	Q92558	559 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	VCAN	P13611	3396 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RBM33-208	ENST00000438356	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356		A6NJR5	290 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	FIBP	O43427	364 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ST18	O60284	1047 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	MMP3	P08254	477 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	FOSL2	P15408	326 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	SCRN1	Q12765	414 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	NEDD9	Q14511	834 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	RABEP1	Q15276	862 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	RGS20	O76081	388 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	RABGGTB	P53611	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	PKN1	Q16512	942 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	KAT2B	Q92831	832 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	MAFG	O15525	162 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	GGPS1	O95749	300 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	MYOG	P15173	224 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	DGKD	Q16760	1214 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ME3	Q16798	604 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	GBF1	Q92538	1859 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	FGB	P02675	491 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ICAM3	P32942	547 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	MTMR1	Q13613	665 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	TRIM29	Q14134	588 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	SREBF1	P36956	1147 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM33-208	ENST00000438356	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms