RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 PPTC7Q8NI37 304 aa34.17■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA33Q96N06 139 aa34.17■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 UIMC1Q96RL1 719 aa34.17■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 TELO2Q9Y4R8 837 aa34.17■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 MOXD2PA6NHM9 499 aa34.16■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 MMP3P08254 477 aa34.16■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 PDCP20941 246 aa34.16■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 PPP4R3AQ6IN85 833 aa34.16■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 C11orf49Q9H6J7 331 aa34.16■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 SYT1P21579 422 aa34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 MCTP1Q6DN14 999 aa34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 FERMT2Q96AC1 680 aa34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 WNT7AO00755 349 aa34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF577Q9BSK1 485 aa34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 NFASCO94856 1347 aa34.14■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 MSH4O15457 936 aa34.14■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 SLC37A4O43826 429 aa34.14■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 ZEB2O60315 1214 aa34.14■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 RGS19P49795 217 aa34.14■■■■□ 3.06
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PQY0 241 aa34.13■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 DHX15O43143 795 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 CXCL17Q6UXB2 119 aa34.13■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 SP4Q02446 784 aa34.12■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 SDF4Q9BRK5 362 aa34.12■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 MYL3P08590 195 aa34.11■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 PURAQ00577 322 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 GPR20Q99678 358 aa34.11■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 BECN1Q14457 450 aa34.11■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 DGKDQ16760 1214 aa34.11■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 POLR3EQ9NVU0 708 aa34.11■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 PPFIA4O75335 1185 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 ATP2B1P20020 1258 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 ETNPPLQ8TBG4 499 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 SLC5A5Q92911 643 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 GJA10Q969M2 543 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 TBC1D22BQ9NU19 505 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 SLC9A2Q9UBY0 812 aa34.1■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 NOP56O00567 594 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 GLT1D1Q96MS3 346 aa34.09■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 KPNA6O60684 536 aa34.08■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 POTEDQ86YR6 584 aa34.08■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 KCNMB3Q9NPA1 279 aa34.08■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 STARD7Q9NQZ5 370 aa34.08■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa34.07■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 CABYRO75952 493 aa34.07■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
PKDCC-202ENST00000401498 ELP1O95163 1332 aa34.07■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 STX6O43752 255 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 CCNE2O96020 404 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 TRAPPC10P48553 1259 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 RIT2Q99578 217 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 MTMR6Q9Y217 621 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 SEPT1Q8WYJ6 367 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 KAT2BQ92831 832 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 HAS1Q92839 578 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 VTI1AQ96AJ9 217 aa34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 ALPK3Q96L96 1907 aa34.05■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 PSMD10O75832 226 aa34.05■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF286BP0CG31 522 aa34.05■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 ACTR2P61160 394 aa34.05■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 FERMT3Q86UX7 667 aa34.05■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 C16orf70Q9BSU1 422 aa34.05■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 GRIN2DO15399 1336 aa34.04■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 MCM7P33993 719 aa34.04■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 PSMC6P62333 389 aa34.04■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 NBR1Q14596 966 aa34.04■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 TTC38Q5R3I4 469 aa34.04■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 LRCH2Q5VUJ6 765 aa34.04■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 TBX3O15119 743 aa34.03■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF174Q15697 407 aa34.03■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC26Q2I0M4 334 aa34.03■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 FAM20AQ96MK3 541 aa34.03■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 NEMFO60524 1076 aa34.02■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 GAS7O60861 476 aa34.02■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 LGALS2P05162 132 aa34.02■■■■□ 3.04
PKDCC-202ENST00000401498 SNX17Q15036 470 aa34.02■■■■□ 3.04
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