RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369592.1

SMNDC1-201, Transcript of survival motor neuron domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SMNDC1, Length 1,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMNDC1-201ENST00000369592 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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SMNDC1-201ENST00000369592 ANO3Q9BYT9 981 aa23.52■■□□□ 1.36
SMNDC1-201ENST00000369592 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.52■■□□□ 1.36
SMNDC1-201ENST00000369592 TMEM260Q9NX78 707 aa23.52■■□□□ 1.36
SMNDC1-201ENST00000369592 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.52■■□□□ 1.36
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SMNDC1-201ENST00000369592 IL23AQ9NPF7 189 aa23.51■■□□□ 1.35
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SMNDC1-201ENST00000369592 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.5■■□□□ 1.35
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SMNDC1-201ENST00000369592 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.5■■□□□ 1.35
SMNDC1-201ENST00000369592 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.5■■□□□ 1.35
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SMNDC1-201ENST00000369592 H3BRB1 525 aa23.47■■□□□ 1.35
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SMNDC1-201ENST00000369592 MCTP2Q6DN12 878 aa23.46■■□□□ 1.35
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SMNDC1-201ENST00000369592 STK3Q13188 491 aa23.44■■□□□ 1.34
SMNDC1-201ENST00000369592 PTK7Q13308 1070 aa23.44■■□□□ 1.34
SMNDC1-201ENST00000369592 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SMNDC1-201ENST00000369592 BFSP2Q13515 415 aa23.44■■□□□ 1.34
SMNDC1-201ENST00000369592 TRIM50Q86XT4 487 aa23.44■■□□□ 1.34
SMNDC1-201ENST00000369592 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.44■■□□□ 1.34
SMNDC1-201ENST00000369592 WNT8BQ93098 351 aa23.44■■□□□ 1.34
SMNDC1-201ENST00000369592 FAM161BQ96MY7 647 aa23.44■■□□□ 1.34
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