RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 HIPK3Q9H422 1215 aa5.69□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 SLC28A3Q9HAS3 691 aa5.69□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 STIM2Q9P246 746 aa5.69□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 SWAP70Q9UH65 585 aa5.69□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa5.69□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 GBF1Q92538 1859 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ARVCFO00192 962 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 GPR182O15218 404 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 FZD6O60353 706 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 NDUFB10O96000 172 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 SMPD1P17405 629 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 RBL2Q08999 1139 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 NR5A1Q13285 461 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ACVR2BQ13705 512 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 RAB30Q15771 203 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 SDE2Q6IQ49 451 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 RASGRP2Q7LDG7 609 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 SPRED2Q7Z698 418 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 FAM126BQ8IXS8 530 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CRIPAKQ8N1N5 446 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 REPS2Q8NFH8 660 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TEX13BQ9BXU2 312 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 SPC25Q9HBM1 224 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 MUC3AQ02505 3323 aa5.68□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ROBO3Q96MS0 1386 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 FAM187AA6NFU0 413 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 EPOPA6NHQ4 379 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 B4GALT4O60513 344 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ZBED4O75132 1171 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ARHGEF15O94989 841 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 FGBP02675 491 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CA3P07451 260 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CYP2C9P11712 490 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ADD2P35612 726 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CTC1Q2NKJ3 1217 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 PKDCCQ504Y2 493 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 FAM47CQ5HY64 1035 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 C12orf60Q5U649 245 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CTR9Q6PD62 1173 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC174Q6PII3 467 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 C16orf86Q6ZW13 317 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TLK2Q86UE8 772 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ERC1Q8IUD2 1116 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 KLHDC9Q8NEP7 349 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ARNTL2Q8WYA1 636 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 FGD4Q96M96 766 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TOX2Q96NM4 488 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 EPHX3Q9H6B9 360 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 IL23AQ9NPF7 189 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CLIP2Q9UDT6 1046 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ASTN1O14525 1302 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 MROH7Q68CQ1 1323 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa5.67□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 F5H6K3 240 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 J3QL48 77 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CTAGE5O15320 804 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CLSTN1O94985 981 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 APPP05067 770 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 MYL3P08590 195 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ALAS1P13196 640 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 COPB2P35606 906 aa5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms