RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 SLMAPQ14BN4 828 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 JDP2Q8WYK2 163 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 HESX1Q9UBX0 185 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 ABCC2Q92887 1545 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 OR52Z1P0C646 297 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 GJA10Q969M2 543 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 SUCLG2Q96I99 432 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 MYO1FO00160 1098 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 GFPT2O94808 682 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 HSPA4LO95757 839 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIM60Q495X7 471 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 APOL6Q9BWW8 343 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 LPXNO60711 386 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 SZRD1Q7Z422 152 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 HOOK2Q96ED9 719 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 FMO2Q99518 471 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC13A4Q9UKG4 626 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF521Q96K83 1311 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 IKBKBO14920 756 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 HSPH1Q92598 858 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 PBKQ96KB5 322 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.9□□□□□ -0.5
GTF3C1-201ENST00000356183 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.9□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 KCNA1Q09470 495 aa11.9□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.9□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.9□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A1W2PQ27 194 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A1W2PQ64 194 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A1W2PQD8 194 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PYGLP06737 847 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PTK2Q05397 1052 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CLEC17AQ6ZS10 378 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 FLCNQ8NFG4 579 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CHUKO15111 745 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 AP2B1P63010 937 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM8A1Q9UBU6 413 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PYGBP11216 843 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 LRRC41Q15345 812 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 VCAM1P19320 739 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 HACE1Q8IYU2 909 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SH3GL3Q99963 347 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 MLXIPQ9HAP2 919 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ZBTB22O15209 634 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 IGBP1P78318 339 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 SEPT2Q15019 361 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ATG3Q9NT62 314 aa11.89□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CLIC2O15247 247 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 GGCXP38435 758 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PTGDRQ13258 359 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ITM2BQ9Y287 266 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 ADCY2Q08462 1091 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 RAD23BP54727 409 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 NEK9Q8TD19 979 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TSPY1Q01534 308 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 GGA1Q9UJY5 639 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C1-201ENST00000356183 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 512.4 ms