RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 ATP9AO75110 1047 aa27.05■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 TGFB3P10600 412 aa27.05■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 CYP2B6P20813 491 aa27.05■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 SDF4Q9BRK5 362 aa27.05■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 VTA1Q9NP79 307 aa27.05■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 NFASCO94856 1347 aa27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 DHX15O43143 795 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 KCNA2P16389 499 aa27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 KRT79Q5XKE5 535 aa27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 NCAPH2Q6IBW4 605 aa27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 CABP7Q86V35 215 aa27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 ERMNQ8TAM6 284 aa27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa27.04■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF202O95125 648 aa27.03■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 SENP7Q9BQF6 1050 aa27.03■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC39Q9UFE4 941 aa27.03■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 KINO60870 393 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 OLFML2BQ68BL8 750 aa27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 HAUS3Q68CZ6 603 aa27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 B3GNT9Q6UX72 402 aa27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 RASSF8Q8NHQ8 419 aa27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 SNX29Q8TEQ0 813 aa27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 UNC45AQ9H3U1 944 aa27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 PCNTO95613 3336 aa27.02■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 KRT76Q01546 638 aa27.01■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 PDILTQ8N807 584 aa27.01■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 CALML4Q96GE6 196 aa27.01■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 PANK2Q9BZ23 570 aa27.01■■□□□ 1.92
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC26A4O43511 780 aa27.01■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 CHMP2AO43633 222 aa27.01■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 FKTNO75072 461 aa27.01■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 HOXD10P28358 340 aa27.01■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 CD99L2Q8TCZ2 262 aa27.01■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 SCFD2Q8WU76 684 aa27.01■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 ERO1AQ96HE7 468 aa27.01■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa27.01■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 SP2Q02086 613 aa27■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 NEDD9Q14511 834 aa27■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 TTLL4Q14679 1199 aa27■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 KARSQ15046 597 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 DISC1Q9NRI5 854 aa27■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 EML1O00423 815 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 FLT3LGP49771 235 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 PRKCZQ05513 592 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 ARHGEF6Q15052 776 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 IQUBQ8NA54 791 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 TIGD1Q96MW7 591 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 KATNBL1Q9H079 304 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 FLRT1Q9NZU1 646 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 USP25Q9UHP3 1055 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 GABRQQ9UN88 632 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 DOCK5Q9H7D0 1870 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 A0A087X0B3 334 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 GNRH1P01148 92 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 SFNP31947 248 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 JAK3P52333 1124 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 IRF5Q13568 498 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 CCL14Q16627 93 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 RRAGBQ5VZM2 374 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 TAPT1Q6NXT6 567 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 MIER3Q7Z3K6 550 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 DHX58Q96C10 678 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 CAP1Q01518 475 aa26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 ACVR2BQ13705 512 aa26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 EPHA7Q15375 998 aa26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC62Q6P9F0 684 aa26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 PDGFCQ9NRA1 345 aa26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC9A2Q9UBY0 812 aa26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 WDR64B1ANS9 1081 aa26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 TXNP10599 105 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 RPA1P27694 616 aa26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 STAT6P42226 847 aa26.97■■□□□ 1.91
CCDC71L-201ENST00000315965 LY6KQ17RY6 165 aa26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms