RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
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TRIM54-201ENST00000296098 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa26.57■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 GUCA1BQ9UMX6 200 aa26.57■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.57■■□□□ 1.84
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TRIM54-201ENST00000296098 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
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TRIM54-201ENST00000296098 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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TRIM54-201ENST00000296098 TRIM10Q9UDY6 481 aa26.56■■□□□ 1.84
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF76P36508 570 aa26.56■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF662Q6ZS27 426 aa26.56■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 KIAA1328Q86T90 577 aa26.56■■□□□ 1.84
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TRIM54-201ENST00000296098 ARSHQ5FYA8 562 aa26.55■■□□□ 1.84
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TRIM54-201ENST00000296098 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.55■■□□□ 1.84
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TRIM54-201ENST00000296098 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.54■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 JAKMIP2Q96AA8 810 aa26.54■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 MMRN2Q9H8L6 949 aa26.54■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 EPHB6O15197 1021 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 EHBP1Q8NDI1 1231 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 SCFD1Q8WVM8 642 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 PLAGL2Q9UPG8 496 aa26.53■■□□□ 1.84
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TRIM54-201ENST00000296098 GNA14O95837 355 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 DPEP1P16444 411 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC174Q6PII3 467 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 TMCO3Q6UWJ1 677 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 KCTD10Q9H3F6 313 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.53■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 SH2D4AQ9H788 454 aa26.53■■□□□ 1.84
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TRIM54-201ENST00000296098 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 CYP2W1Q8TAV3 490 aa26.52■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 VPS33BQ9H267 617 aa26.52■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 EPC1Q9H2F5 836 aa26.52■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.52■■□□□ 1.84
TRIM54-201ENST00000296098 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.51■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 CFBP00751 764 aa26.51■■□□□ 1.83
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TRIM54-201ENST00000296098 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa26.51■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.51■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 NIM1KQ8IY84 436 aa26.51■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 KRT222Q8N1A0 295 aa26.51■■□□□ 1.83
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TRIM54-201ENST00000296098 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.51■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.51■■□□□ 1.83
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TRIM54-201ENST00000296098 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
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TRIM54-201ENST00000296098 KCNA3P22001 575 aa26.51■■□□□ 1.83
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TRIM54-201ENST00000296098 NEK11Q8NG66 645 aa26.5■■□□□ 1.83
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TRIM54-201ENST00000296098 TFR2Q9UP52 801 aa26.5■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 PLA2G6O60733 806 aa26.49■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 CYP4A11Q02928 519 aa26.49■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 EDRF1Q3B7T1 1238 aa26.49■■□□□ 1.83
TRIM54-201ENST00000296098 FAM160B2Q86V87 743 aa26.49■■□□□ 1.83
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