RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291892.10

RDH13-201, Transcript of retinol dehydrogenase 13, humanhuman

TSL 2

Gene RDH13, Length 3,022 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13-201ENST00000291892 P3H4Q92791 437 aa14.87□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.87□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 MYH7P12883 1935 aa14.87□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 AZI2Q9H6S1 392 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 MBD4O95243 580 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 FERP16591 822 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 RFC5P40937 340 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 LIFRP42702 1097 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 MSH2P43246 934 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 ADCY1Q08828 1119 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 STK4Q13043 487 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 SOGA3Q5TF21 947 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 SYT15Q9BQS2 421 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 SLIT1O75093 1534 aa14.86□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 CFAP73A6NFT4 308 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 A6NHS1 94 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 ADD2P35612 726 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 SCNN1BP51168 640 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 ANO7Q6IWH7 933 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 RAD23BP54727 409 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 CASP7P55210 303 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 ASIC1P78348 528 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 RIPK1Q13546 671 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 TBC1D5Q92609 795 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 MYH1P12882 1939 aa14.85□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 KRIT1O00522 736 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 HIP1RO75146 1068 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 CNKSR1Q969H4 720 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 TMEM165Q9HC07 324 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 F8VZ95 297 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 NLRP5P59047 1200 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 MFN1Q8IWA4 741 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 P2RX5Q93086 422 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 MTMR7Q9Y216 660 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 RNF8O76064 485 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 SLMAPQ14BN4 828 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 RPS6KA1Q15418 735 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 RGL1Q9NZL6 768 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 AFF2P51816 1311 aa14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RDH13-201ENST00000291892 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 PAEPP09466 180 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 PDE6AP16499 860 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 UBA7P41226 1012 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 PKN1Q16512 942 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 DIP2AQ14689 1571 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 GSTA1P08263 222 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 METTL24Q5JXM2 366 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 GDAP1Q8TB36 358 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 DISC1Q9NRI5 854 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 PIK3C2AO00443 1686 aa14.83□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 ADAM9Q13443 819 aa14.82□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 DAAM2Q86T65 1068 aa14.82□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.82□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.82□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.82□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.82□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.82□□□□□ -0.04
RDH13-201ENST00000291892 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms