RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa16.45■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 GUCY2FP51841 1108 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 GSTO1P78417 241 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 PDE4CQ08493 712 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 COASYQ13057 564 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 KRT79Q5XKE5 535 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 CD302Q8IX05 232 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 TBC1D5Q92609 795 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 CEP95Q96GE4 821 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ZNF287Q9HBT7 754 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 SBF2Q86WG5 1849 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 USP17L5A8MUK1 530 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 TRAF5O00463 557 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 CLSTN1O94985 981 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 TM4SF1P30408 202 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 TRADDQ15628 312 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 SLC18A3Q16572 532 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 RAB34Q9BZG1 259 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 NYXQ9GZU5 481 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 POLD4Q9HCU8 107 aa16.44■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 GUCY2CP25092 1073 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 INPP5BP32019 993 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 EMC10Q5UCC4 262 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 COA7Q96BR5 231 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 A0A087X0T9 212 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ZEB2O60315 1214 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 FAM228BP0C875 321 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 UTRNP46939 3433 aa16.43■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 LSP1P33241 339 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ADCY7P51828 1080 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 GUCY1A3Q02108 690 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 RAD51CO43502 376 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 KIAA0753Q2KHM9 967 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 WHAMMQ8TF30 809 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 SETDB2Q96T68 719 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 PANK4Q9NVE7 773 aa16.42■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 MYBP10242 640 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 NR1D1P20393 614 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 BTDP43251 543 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ARID5AQ03989 594 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 CERS3Q8IU89 383 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 TRIM59Q8IWR1 403 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 USP38Q8NB14 1042 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 CEP63Q96MT8 703 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 EPN3Q9H201 632 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 LDHCP07864 332 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 PDHBP11177 359 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 NOVP48745 357 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 GJA10Q969M2 543 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 AIPL1Q9NZN9 384 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 KLHL30Q0D2K2 578 aa16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 SEPT2Q15019 361 aa16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 HAS1Q92839 578 aa16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 NAA35Q5VZE5 725 aa16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms