RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 TAF1P21675 1872 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 NOL4O94818 638 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 DRP2Q13474 957 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 C12orf60Q5U649 245 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 TMC4Q7Z404 712 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 RPAINQ86UA6 219 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 C3orf20Q8ND61 904 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 KRT12Q99456 494 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 H0YHG0 523 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 KLRC1P26715 233 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 GUCY2FP51841 1108 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 ATP2B2Q01814 1243 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 USP38Q8NB14 1042 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 PNMA5Q96PV4 448 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.96□□□□□ -0.01
LRRC17-201ENST00000249377 RAD51CO43502 376 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L8P0C7I0 530 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ECHS1P30084 290 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SMTNP53814 917 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TNNC1P63316 161 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PSMD2Q13200 908 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SLC18A3Q16572 532 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 AKT1S1Q96B36 256 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 MTMR9Q96QG7 549 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ISCUQ9H1K1 167 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PLAAQ9Y263 795 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 FTCDO95954 541 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 GNA11P29992 359 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PRDX5P30044 214 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 MAP2K2P36507 400 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SEC24CP53992 1094 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 NAPAP54920 295 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TSG101Q99816 390 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 C6orf50Q9HD87 102 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.95□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 H0YGN5 161 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 RASSF9O75901 435 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TRADDQ15628 312 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 RAD54LQ92698 747 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 POLD4Q9HCU8 107 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 NFS1Q9Y697 457 aa14.94□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L3A6NCW0 530 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L4A6NCW7 530 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SMCO2A6NFE2 343 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 RPS6KA4O75676 772 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CUL1Q13616 776 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 KLRK1P26718 216 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 HSD17B3P37058 310 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ERVK-9P63128 1117 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 DYMQ7RTS9 669 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TBCKQ8TEA7 893 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SCFD2Q8WU76 684 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms