RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 DNM3Q9UQ16 869 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 UTRNP46939 3433 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 HOOK2Q96ED9 719 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 MTMR2Q13614 643 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 DESI2Q9BSY9 194 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 NFIBO00712 420 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 VCAM1P19320 739 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 CYP4A11Q02928 519 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 GIT2Q14161 759 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 DCAF15Q66K64 600 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 RGL1Q9NZL6 768 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 COL20A1Q9P218 1284 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 TTC26A0AVF1 554 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 KRT9P35527 623 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 GHRHRQ02643 423 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 PPP2R5CQ13362 524 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.54■□□□□ 0.88
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HOXC11-201ENST00000243082 RASSF10A6NK89 507 aa20.53■□□□□ 0.88
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HOXC11-201ENST00000243082 ERVK-24P63145 666 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 CPXCR1Q8N123 301 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 RPTORQ8N122 1335 aa20.53■□□□□ 0.88
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HOXC11-201ENST00000243082 FLOT1O75955 427 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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HOXC11-201ENST00000243082 SPP2Q13103 211 aa20.53■□□□□ 0.88
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HOXC11-201ENST00000243082 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 TSG101Q99816 390 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 SLITRK3O94933 977 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 EYA4O95677 639 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 USP14P54578 494 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC11-201ENST00000243082 FANCGO15287 622 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC175P0C221 793 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 ALAS1P13196 640 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 SYCP1Q15431 976 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 REEP2Q9BRK0 252 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 FZD1Q9UP38 647 aa20.51■□□□□ 0.87
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HOXC11-201ENST00000243082 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 GAS7O60861 476 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 ITGB5P18084 799 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 PTPRAP18433 802 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 KLK7P49862 253 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 BACE1P56817 501 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 VWA3BQ502W6 1294 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 DYDC2Q96IM9 177 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC11-201ENST00000243082 WRNIP1Q96S55 665 aa20.51■□□□□ 0.87
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