RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ODC1-201ENST00000234111 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.28■■□□□ 1.32
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ODC1-201ENST00000234111 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 KIF2BQ8N4N8 673 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.24■■□□□ 1.31
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ODC1-201ENST00000234111 DPH5Q9H2P9 285 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
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ODC1-201ENST00000234111 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 PDE8BO95263 885 aa23.23■■□□□ 1.31
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