RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216044.9

GTPBP1-201, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTPBP1, Length 5,126 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-201ENST00000216044 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.96■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GSDMBQ8TAX9 411 aa15.96■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 Q9H521 79 aa15.96■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 PDHBP11177 359 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 DDIT3P35638 169 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 UBXN2AP68543 259 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 PAK2Q13177 524 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 PPP2R5EQ16537 467 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 FANCCQ00597 558 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 SPP2Q13103 211 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 EHD4Q9H223 541 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 OSBPP22059 807 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.145e-8■■□□□ 13.7
GTPBP1-201ENST00000216044 EVCP57679 992 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 SEC23AQ15436 765 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 NELFBQ8WX92 580 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 RHOXF2BP0C7M4 288 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 SLFN14P0C7P3 912 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 KIF11P52732 1056 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GPBP1Q86WP2 473 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 RHOXF2Q9BQY4 288 aa15.95■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 RESP18Q5W5W9 173 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 AK9Q5TCS8 1911 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 ZBTB17Q13105 803 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 LRCH2Q5VUJ6 765 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 IL17RAQ96F46 866 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 NDUFB10O96000 172 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 ZNF75DP51815 510 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GRIK5Q16478 980 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 MUM1L1Q5H9M0 696 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GAKO14976 1311 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.94■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 RNF40O75150 1001 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 SYT10Q6XYQ8 523 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 SMARCA1P28370 1054 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GSDMAQ96QA5 445 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 USP17L15C9J2P7 530 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 USP17L11C9JVI0 530 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 USP17L18D6R9N7 530 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 USP17L22D6RA61 530 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 USP17L19D6RCP7 530 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 USP17L20D6RJB6 530 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 USP17L24Q0WX57 530 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 GGA3Q9NZ52 723 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 VGLL3A8MV65 326 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 DAPK3O43293 454 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 ZNF131P52739 623 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 BIRC3Q13489 604 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 MYCT1Q8N699 235 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 FAM212AQ96EL1 285 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 CABS1Q96KC9 395 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 AZI2Q9H6S1 392 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 TBC1D7Q9P0N9 293 aa15.93■□□□□ 0.14
GTPBP1-201ENST00000216044 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.93■□□□□ 0.14
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