RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 MDM1Q8TC05 714 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 NEK9Q8TD19 979 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 PPP1R14BQ96C90 147 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 EHD2Q9NZN4 543 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 NFS1Q9Y697 457 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 BNIP1Q12981 228 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 ERMNQ8TAM6 284 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 UCMAQ8WVF2 138 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 IQCDQ96DY2 449 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CLMNQ96JQ2 1002 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 NLRP3Q96P20 1036 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 RMND1Q9NWS8 449 aa12.86□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 DLC1Q96QB1 1528 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 GNA14O95837 355 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CLCN2P51788 898 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 COPB1P53618 953 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 SPAG1Q07617 926 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 STK32AQ8WU08 396 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 AZIN2Q96A70 460 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 FAM136AQ96C01 138 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 DNAJC7Q99615 494 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 TIPINQ9BVW5 301 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 ABCC12Q96J65 1359 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 NDUFB5O43674 189 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CACNA2D1P54289 1103 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 UBXN1Q04323 297 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 GALNTL6Q49A17 601 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 WDR59Q6PJI9 974 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa12.85□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM247A6NEH6 219 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CPLX1O14810 134 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 MMEP08473 750 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 TPBGLP0DKB5 382 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 PSMD7P51665 324 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF554Q86TJ5 538 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 PALB2Q86YC2 1186 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CCNJLQ8IV13 435 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 LRRC34Q8IZ02 419 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 WDR60Q8WVS4 1066 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 PBKQ96KB5 322 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 MAP3K14Q99558 947 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 PDP2Q9P2J9 529 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 GGT7Q9UJ14 662 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 PTPRUQ92729 1446 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 RFX7Q2KHR2 1363 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 DCDC2CA8MYV0 355 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 BCRP11274 1271 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 KCNA6P17658 529 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 TEFQ10587 303 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CNPY1Q3B7I2 92 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 SMUG1Q53HV7 270 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 VPS37DQ86XT2 251 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 SAMD3Q8N6K7 520 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 SPATA20Q8TB22 786 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 NCSTNQ92542 709 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 INIPQ9NRY2 104 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 TAB2Q9NYJ8 693 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 LRCH1Q9Y2L9 728 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 P4HA2O15460 535 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CD44P16070 742 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 KCNA3P22001 575 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 PLS1Q14651 629 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 SLC44A4Q53GD3 710 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 ASRGL1Q7L266 308 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 SLC17A8Q8NDX2 589 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 RNF14Q9UBS8 474 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 RABL2BQ9UNT1 228 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa12.84□□□□□ -0.35
SPIN3-241ENST00000640511 A0A0G2JS52 829 aa12.83□□□□□ -0.36
SPIN3-241ENST00000640511 WASLO00401 505 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SPIN3-241ENST00000640511 SPATA31D3P0C874 917 aa12.83□□□□□ -0.36
SPIN3-241ENST00000640511 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SPIN3-241ENST00000640511 CRB1P82279 1406 aa12.83□□□□□ -0.36
SPIN3-241ENST00000640511 LSAMPQ13449 338 aa12.83□□□□□ -0.36
SPIN3-241ENST00000640511 KRT71Q3SY84 523 aa12.83□□□□□ -0.36
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM53Q6P2H8 277 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms