RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636093.1

U6.111-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 83 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.111-201ENST00000636093 SLC44A4Q53GD3 710 aa0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 NAT16Q8N8M0 369 aa0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 SUPT20HQ8NEM7 779 aa0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 CCDC74AQ96AQ1 378 aa0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 AJUBAQ96IF1 538 aa0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 EBF3Q9H4W6 596 aa0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 MINPP1Q9UNW1 487 aa0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 TRAK1Q9UPV9 953 aa0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 FAM20BO75063 409 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 PAGE1O75459 146 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 KLHL18O94889 574 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 COL6A1P12109 1028 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 CXCR5P32302 372 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 STAT5AP42229 794 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 NOVP48745 357 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 TNNI2P48788 182 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 TAF6P49848 677 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 ZNF134P52741 427 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 USP14P54578 494 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 FCGRTP55899 365 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 LRRC14Q15048 493 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 LRRC55Q6ZSA7 311 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 PHACTR4Q8IZ21 702 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 NLGN2Q8NFZ4 835 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 PLA2G3Q9NZ20 509 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 FZD1Q9UP38 647 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 PTPN22Q9Y2R2 807 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 SAMM50Q9Y512 469 aa0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 LRRC3CA6NJW4 275 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 MATN2O00339 956 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 CELA2AP08217 269 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 VAV1P15498 845 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 SCNN1GP51170 649 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 RNF151Q2KHN1 245 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 CR1LQ2VPA4 569 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 RTP2Q5QGT7 225 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 D2HGDHQ8N465 521 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 ACRBPQ8NEB7 543 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 MARK4Q96L34 752 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 CTAGE1Q96RT6 745 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 SIT1Q9Y3P8 196 aa0.66□□□□□ -2.3
U6.111-201ENST00000636093 UPK3BL1B0FP48 263 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 UPK3BL2E5RIL1 263 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 GFRA2O00451 464 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 C1QL1O75973 258 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 USP5P45974 858 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 ADCY1Q08828 1119 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 PI16Q6UXB8 463 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 Q6ZRM9 215 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 ZNF662Q6ZS27 426 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 C18orf65Q6ZTR6 163 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 AEBP1Q8IUX7 1158 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 DBF4BQ8NFT6 615 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 FAM200AQ8TCP9 573 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 DDB2Q92466 427 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 C16orf92Q96LL3 132 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 WRNIP1Q96S55 665 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 TLK1Q9UKI8 766 aa0.65□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 ENC1O14682 589 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 SIGLEC6O43699 453 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 LMNB1P20700 586 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 PLA2G5P39877 138 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 CTSKP43235 329 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 NKX3-2P78367 333 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 USP10Q14694 798 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 ETFDHQ16134 617 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 ZNF260Q3ZCT1 412 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 WWC2Q6AWC2 1192 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 CYP2R1Q6VVX0 501 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 FAM126BQ8IXS8 530 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 GJD3Q8N144 294 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 KREMEN2Q8NCW0 462 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 GAL3ST3Q96A11 431 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 CYP8B1Q9UNU6 501 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 ZNF804BA4D1E1 1349 aa0.64□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 WIPF3A6NGB9 483 aa0.63□□□□□ -2.31
U6.111-201ENST00000636093 MEIS1O00470 390 aa0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms