RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	DCAF15	Q66K64	600 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	JAML	Q86YT9	394 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PPT2	Q9UMR5	302 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PLIN1	O60240	522 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ITGA4	P13612	1032 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	CD247	P20963	164 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	MAPKAPK2	P49137	400 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF445	P59923	1031 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	RPTN	Q6XPR3	784 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	RGS22	Q8NE09	1264 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PRAM1	Q96QH2	718 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK19	Q9BWU1	502 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	STK26	Q9P289	416 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A087WZG4	1122 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	FYB1	O15117	783 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	SASH1	O94885	1247 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	VAMP1	P23763	118 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	CORO7	P57737	925 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	POU4F1	Q01851	419 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	TCEAL1	Q15170	157 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	LDHD	Q86WU2	507 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	FIBCD1	Q8N539	461 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PANK1	Q8TE04	598 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ALK	Q9UM73	1620 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP7B	P35670	1465 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PQJ5	194 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	SRGAP3	O43295	1099 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM13	O60858	407 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D8	O95759	1140 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	MVK	Q03426	396 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM129C	Q86XR2	697 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	SP8	Q8IXZ3	490 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	BRF1	Q92994	677 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	RELT	Q969Z4	430 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPRM	P28827	1452 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	DIP2B	Q9P265	1576 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	BCAR3	O75815	825 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	CYBB	P04839	570 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PFKL	P17858	780 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	SOX9	P48436	509 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PTPRM-215	ENST00000583289	GBP3	Q9H0R5	595 aa		5.67	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms