RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CCNE1P24864 410 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRB-208ENST00000550358 PARVGQ9HBI0 331 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-208ENST00000550358 CEP152O94986 1710 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRB-208ENST00000550358 KRIT1O00522 736 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRB-208ENST00000550358 CASC4Q6P4E1 433 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRB-208ENST00000550358 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRB-208ENST00000550358 FAM71BQ8TC56 605 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRB-208ENST00000550358 TBCKQ8TEA7 893 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRB-208ENST00000550358 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
PTPRB-208ENST00000550358 CYP21A2P08686 494 aa9.23□□□□□ -0.93
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