RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536265.5

DDX11-208, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 5

Gene DDX11, Length 3,603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-208	ENST00000536265	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	FEM1B	Q9UK73	627 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	MICALL2	Q8IY33	904 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	MTFR1L	Q9H019	292 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	PICK1	Q9NRD5	415 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	STK24	Q9Y6E0	443 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	PSMD2	Q13200	908 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	TTI2	Q6NXR4	508 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	KCNK18	Q7Z418	384 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	LDHD	Q86WU2	507 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	COASY	Q13057	564 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	MTF1	Q14872	753 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	GML	Q99445	158 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	DCAF15	Q66K64	600 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	UBXN4	Q92575	508 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	HOOK2	Q96ED9	719 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	NUP58	Q9BVL2	599 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	FAM13A	O94988	1023 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	GYPC	P04921	128 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	SREBF1	P36956	1147 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	NSMF	Q6X4W1	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	MYH8	P13535	1937 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	SHTN1	A0MZ66	631 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	KCNA3	P22001	575 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	PRKG1	Q13976	671 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	TBC1D5	Q92609	795 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	TBX3	O15119	743 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	LRRC63	Q05C16	580 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	LRRC15	Q8TF66	581 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	ZBED4	O75132	1171 aa		12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	SPA17	Q15506	151 aa		12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	FAM86B1	E9PN63	330 aa		12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	MED24	O75448	989 aa		12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
DDX11-208	ENST00000536265	TTC26	A0AVF1	554 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	CETN3	O15182	167 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	MSH4	O15457	936 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	SPP2	Q13103	211 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	NEK11	Q8NG66	645 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	ERO1A	Q96HE7	468 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	POLD4	Q9HCU8	107 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	RGL1	Q9NZL6	768 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	ABCB11	O95342	1321 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	RASSF7	Q02833	373 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	GCNT3	O95395	438 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	ECM1	Q16610	540 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	MAN2A1	Q16706	1144 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-208	ENST00000536265	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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